Anden sæson af THE BOYS er endnu mere desperat, da Butcher, Hughie og resten af gruppen er på flugt fra loven efter nederlaget i første sæson. De forsøger stadig ihærdigt at kæmpe imod superheltene, mens Vought (firmaet, der varetager superheltene) vil misbruge frygten for superskurke. En ny superhelt, Stormfront, vender op og ned på situationen, da hun ikke føjer den ustabile Homelander.