Sulla strada per Fractalopoli Clem scopre un piccolo Pokémon verde nascosto nella sua borsetta. Il Pokédex non è in grado di identificarlo, così la bimba decide di chiamarlo Mollicino. Poco dopo, i nostri eroi incontrano il loro amico Sandro e il suo Grovyle. Ma l’allegria è presto rovinata da un gruppo di persone vestite di rosso con strani occhiali, determinate ad appropriarsi del nuovo amico di Clem! Questi furfanti appartengono al Team Flare e hanno identificato Mollicino come uno dei Nuclei di cui necessitano per la loro “Operazione Z”.