De Amerikaanse CIA-veldagent Johnnie Allen wordt voor zijn eerste missie naar Denemarken gestuurd. Een Amerikaanse spion met een hoge positie in het Kremlin moet Rusland verlaten, en het is Johnnie's taak om hem veilig naar Antwerpen te brengen, waar de agent aan boord van een vrachtschip zal gaan. Johnnie, een jonge homoseksuele man, ontmoet en wordt verliefd op een Deense jongen genaamd Sander, die ogenschijnlijk hetero is. Omdat hij zijn vriend dicht bij hem wil houden, maakt hij de fout hem mee te nemen op de missie. Wat zal er van hun vriendschap worden als Johnnie zijn liefde aan Sander belijdt? En is de Russische agent alles wat hij lijkt te zijn? Tegen de achtergrond van Europese spionage is Happy Endings Sleepover een viering van homoseksuele jongeren in een wereld waar liefde nooit mag bestaan.