De film bestaat uit twee verhalen: “Ishi Okoshi” en “Ayashiki Raihousha”. In 'Ishi Okoshi' ontmoet Natsume een kleine youkai genaamd Mitsumi in een bos. Mitsumi heeft de plicht om de goddelijke youkai 'Iwatetsu' uit zijn diepe slaap te wekken, iets waar Natsume mee instemt te helpen. In 'Ayashiki Raihousha' verschijnt een mysterieuze bezoeker voor Tanuma. Bijna elke dag bezoekt hij Tanuma, praat even met haar en vertrekt dan. Natsume, die weet dat de bezoeker een youkai is, maakt zich zorgen over Tanuma, maar Tanuma geniet van deze gesprekken met de entiteit. De youkai wil hem geen kwaad doen, maar Tanuma's gezondheid begint langzaam achteruit te gaan.